Las Misiones Universitarias reúnen a cientos de jóvenes de la Juventud de Schoenstatt junto a otros jóvenes católicos mayores de 18 años, que apuestan por salir de su comodidad para conocer otras realidades. Se deciden a ponerse en movimiento para difundir un mensaje de esperanza, de alegría y de compromiso con los demás. Porque creen que el cambio empieza desde ahí.
También se realizan Misiones de chicos de colegios secundarios. En ese caso, son organizadas por la Juventud Femenina o Masculina de forma independiente.
Las misiones se realizan durante varios días en diferentes pueblos del país, y los jóvenes llevan a María y a su Hijo, casa por casa, y en cada actividad que realizan con la comunidad que visitan. Comparten momentos fuertes de apostolado, oración y recreación. Contagiando su entusiasmo y su alegría, buscan que la gente pueda experimentar el amor de Dios y se acerque a la fe o se vea confirmada en ella.